产品组成
FastPure Gel Extraction Kit |
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产品编号 |
EK-1104-50T |
EK-1104-100T |
纯化次数 |
50次 |
100次 |
Buffer QG |
30ml |
60ml |
Buffer PB |
30ml |
60ml |
Buffer PW |
12ml |
24ml |
Buffer EB |
10ml |
20ml |
Gel Spin Columns |
50 |
100 |
2ml Collection Tubes |
50 |
100 |
使用手册 |
1 |
1 |
产品介绍
本试剂盒采用可高效、专一结合DNA的硅基质材料和独特的缓冲液系统,可从各种浓度的TAE或TBE琼脂糖凝胶上回收70bp-10kbp大小的DNA片段,也可以用于各种PCR体系中DNA回收,同时除去蛋白质、其它有机化合物、无机盐离子及寡核苷酸引物等杂质,回收率可达80%以上。每个离心吸附柱每次可吸附的DNA量为20μg。使用本试剂盒回收的DNA可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、测序、文库筛选、连接和转化等实验。
存储条件
该试剂盒置于室温(15-25℃)干燥条件下,可保存12个月。Buffer QG/PB可能产生沉淀,若有沉淀使用前可在55℃水浴中预热10 min以溶解。
需要额外准备的材料
□ 无水乙醇(96%-100%)
□ 无菌1.5ml离心管
开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。
□ 电泳时最好使用新的电泳缓冲液,以免影响电泳和回收效果。
□ 如下一步实验要求较高,核酸电泳时则应尽量使用TAE电泳缓冲液。
□ 切胶时,紫外照射时间应尽量短,以免对DNA造成损伤。
□ 如果回收率较低,可在胶充分溶解后检测pH值,如pH值大于7.5,可向含有DNA的胶溶液中加10-30µl 3M醋酸钠(pH5.2)将pH值调到5-7之间。
□ 回收<70bp或>10kbp的DNA片段时,应加大Buffer QG的体积,延长吸附和洗脱时间。
□ 回收率与初始DNA量和洗脱体积有关,初始量越少、洗脱体积越少,回收率越低。
□ 高温及潮湿等不利环境因素对吸附柱产生影响,请将吸附柱储存于阴凉干燥的环境中。
开始前试剂准备
□ 按瓶子标签所示,加入4倍体积的无水乙醇稀释Buffer PW,于室温密封保存。
□ 确认Buffer QG溶液显示为黄色。
DNA浓度及纯度检测
l 回收得到的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。
l DNA应在OD260处有显著吸收峰,OD260值为1相当于大约50μg/ml双链DNA、40μg/ml单链DNA。
l OD260/OD280比值应为1.7-2.0,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用ddH2O比值会偏低,因为pH值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。
操作步骤:
一、琼脂糖回收DNA
1. 配制所需浓度的琼脂糖凝胶,电泳分离DNA片段。当DNA片段分离后,将凝胶置于紫外灯下,用干净锋利的手术刀快速切下含目的片段大小的DNA凝胶。
为避免DNA片段受到损伤,应尽量减少凝胶的紫外照射时间,切胶时应尽量切去多余凝胶。
2. 放入1.5ml离心管中并称取凝胶块的重量,加入3倍体积的Buffer QG(如凝胶称重结果为100mg,则其体积约等于100µl,应加入300µl Buffer QG)。
对于>2%的琼脂糖凝胶,添加6倍体积的Buffer QG。
3. 50℃水浴10min(或直至凝胶完全溶解即可),水浴期间可颠倒混匀加速溶胶。
注意:若回收<300bp的DNA片段可在完全溶胶后加入一倍凝胶体积的异丙醇以提高回收率;胶块完全溶解后最好将溶液温度降至室温再上柱,因为吸附柱在室温时结合DNA能力较强。
4. 凝胶完全溶解后,检查颜色是否为黄色(类似于没有溶解琼脂糖的Buffer QG)。
如果混合物的颜色为橙色或紫色,则加入10µl 3 M 醋酸钠(pH 5.0)并混合,混合物的颜色会变成黄色。DNA吸附到膜上仅在pH ≤ 7.5时有效。Buffer QG含有一种pH指示剂,在pH ≤7.5时为黄色,在较高pH时为橙色或紫色,可通过颜色轻松确定DNA结合的最佳pH。
5. 将吸附柱套在2ml收集管中,并将上一步得到的溶液加入到吸附柱中,≥8000×g (≥10,000 rpm)离心30s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
6. 向吸附柱中加入500µl Buffer PW(已加入无水乙醇),≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
注意:如果回收的DNA是用于盐敏感的实验,例如平末端连接实验或直接测序,建议加入Buffer PW后静置2-5min后再离心。
7. 重复操作步骤7一次。
8. 倒掉收集管中的废液后将吸附柱再次套入收集管中,最大转速 (~13,400×g)离心2min以干燥吸附柱膜,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。将吸附柱套入新的1.5ml 离心管中并于室温开盖放置5-10min彻底晾干。
注意:Buffer PW中的乙醇残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。
9. 向吸附柱膜中央位置悬空滴加30-50µl Buffer EB,盖上盖子室温静置2min后,最大转速 (~13,400×g)离心2min收集DNA溶液并置于-20℃保存。
注意:洗脱体积不应小于30μl,体积过少影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若后续做测序,需使用ddH2O做洗脱液,并保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。为了提高DNA的回收量,可重复操作步骤10一次。
二、从PCR反应液或者酶切反应中回收DNA
1. 将5倍体积的Buffer PB添加到1倍体积的PCR样品中,然后混匀。
例如,将500µl Buffer PB添加到100µl PCR样品(不包括油的体积),无需去除石蜡油或矿物油。
2. 溶液完全溶解后,检查颜色是否为黄色。
如果混合物的颜色为红色,则加入10µl 3 M 醋酸钠(pH 5.0)并混合,混合物的颜色会变成黄色。DNA吸附到膜上仅在pH ≤ 7.5时有效。Buffer PB含有一种pH指示剂,在pH ≤7.5时为黄色,在较高pH时为红色,可通过颜色轻松确定DNA结合的最佳pH。
3. 将吸附柱套在2ml收集管中,并将上一步得到的溶液加入到吸附柱中,≥8000×g (≥10,000 rpm)离心30s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
4. 向吸附柱中加入500µl Buffer PW(已加入无水乙醇),≥8000×g (≥10,000 rpm)离心30s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
注意:如果回收的DNA是用于盐敏感的实验,例如平末端连接实验或直接测序,建议加入Buffer PW后静置2-5min后再离心。
5. 重复操作步骤4一次。
6. 倒掉收集管中的废液后将吸附柱再次套入收集管中,最大转速 (~13,400×g)离心2min以干燥吸附柱膜,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。将吸附柱套入新的1.5ml离心管中并于室温开盖放置5-10min彻底晾干。
7. 向吸附柱膜中央位置悬空滴加30-50µl Buffer EB,盖上盖子室温静置2min后,最大转速 (~13,400×g)离心2min收集DNA溶液并置于-20℃保存。
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